【复旦大学】基因组学精品课

  • 名称:【复旦大学】基因组学精品课
  • 分类:生物医药  
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  • 时间:2023/8/1 16:14:57

掌握基因组学这个学科的起源和发展史、理念和基本概念、研究领域和核心技术,特 别是基因组学对生命科学和生物技术的全面贡献。从不同角度概括了基因组学这一学科的 定义、理念、源流发展趋势及应用范例,了解基因组学相关技术在生命科学和生物产业中 的地位及其对人类社会的影响。

(一)课程任务

本课程是是研究生物染色体上全体基因总和的一门学问,通过对基因组信息以及相关数据系统利用,试图解决生物、医学和工业领域的重大问题的一门技术学科。基因组学主要分为以全基因组测序为目标的结构基因组学和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学。要求学生掌握结构基因组学中第一代到第四代DNA测序方法的主要原理,短片段DNA如何组装成整个染色体的基本原理和生物信息学技术;结构基因组学中的基因过量表达、基因敲除,RNAi等高通量基因功能研究方法。

(二)课程目标

《基因组学》的教学目标是要求学生在学习中以基因组为主线,掌握基因组测序的基本原理、如何对基因功能进行验证,了解基因组学的学科前沿发展动态,关注学科研究中的热点问题,学习中注意综合运用各学科相关知识,理性思维,理顺脉络,联系实际,拓宽思路,以达到培养训练学生分析问题和解决问题能力,增强创新意识,提高综合素质。

三、教学内容和要求

第一章 基因组学概论

介绍基因组学的基本概念和研究内容,使学生了解基因组学的过去、现在和将来的发展趋势。

1. 掌握:结构基因组学、比较基因组的含义;

2. 熟悉:人类基因组计划。

重点与难点:基因组学概念,基因组学研究的对象和任务。

第二章 表观基因组

在基因组的水平上研究表观遗传修饰的学科。

1. 了解:表观遗传学的概念;

2. 掌握:基因组的表观修饰及其作用。

重点:DNA甲基化的概念及作用机理。

第三章 结构基因组学

介绍以全基因组测序为目标的结构基因组学。

1. 掌握:第一代到第四代DNA测序方法的主要原理;

2. 熟悉:短片段DNA如何组装成整个染色体的基本原理和生物信息学技术

重点:DNA测序方法的主要原理。

难点:相关生物信息学技术。

第四章 比较基因组学

对已知基因组的结构进行比较,了解基因的功能,探究基因组的进化

1. 了解比较基因组学的意义;

2. 掌握如何利用比较基因组学探究基因功能。

重点与难点:如何利用比较基因组学探究基因功能。

第五章 功能基因组

通过实验方法验证基因组学中大量基因的功能。

1. 掌握:基因过量表达、基因敲除;

2. 熟悉:RNAi;

重点:相关实验方法的基本原理。

 

         课程目录
0.1 基因组计划缘起
0.2 基因组学重要进展
1.1 DNA RNA 蛋白质
1.2 基因组结构特征
2 遗传图绘制
3 物理图绘制
4.1 基因组测序技术
4.2 全基因组测序
5.1 基因组注释信息分析
5.2 基因组注释实验验证
5.3 基因组编辑
6.1 真核生物基因组
6.2 原核生物及细胞器基因组
7.1 基因的转录调控-PolI-PolIII
7.2 基因的转录调控-PolII
8.1 组成与加工
8.2 定位与降解
8.3 miRNA
8.4 siRNA
8.5 lncRNA